Для поисковых систем домены с www и без www являются разными доменами. Это влияет на ссылочную массу которая естественно делиться на два домена когда наращивание одной происходит как на домены вида www.domen.ru так и domen.ru. Исправить ситуацию поможет файл .htaccess в котором можно прописать 301 первый редирект с одного домена на другой. Делается это так:
С домена без www на домен с www (c domen.ru на www.domen.ru)
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^domen.ru$ [NC]
RewriteRule (.*) http://www.domen.ru/$1 [R=301,L]
C www.domen.ru на domen.ru
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www.domen.ru$ [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://domen.ru/$1 [R=301,L]
Важно!
На сервере включен modrevrite
После того как вы скопируете код обязательно перепишите domen на свой
Проверьте получилось ли У Вас набрав в адресной строке имя своего домен с www и без если произошла смена в зависимости от Ваших настроек то все ок!