После обновления категорий каталога, столкнулся с тем что в меню остались старые категории. Что бы не чистить кэш по одной страничке, можно это сделать цивилизованным способом через «Настройки -> Настройки продукта -> Автокеширование -> Очистка файлов кеша» и выбрать способ который необходим в Вашем случае. 

 очистить кеш 1с-Битрикс